中国科学院上海某分所，是一个集基础研究、应用研究和高技术创新研究为一体的综合性化学研究所，是中国科学院首批成立的15个研究所之一。在我国“两弹一星”研制、“人工合成牛胰岛素、人工合成酵母丙氨酸转移核糖核酸”和“物理有机化学中的两个基本问题：自由基化学中取代基离域参数和有机分子簇集概念”等一批攀登科技高峰的重要成果中，科研人员做出了重要贡献。 1998年上海有机所首批进入中国科学院知识创新工程。从此以多学科交叉为特色，以国家战略和国民经济重大问题为导向，以有机化学基础研究和应用基础研究为主导，围绕人口与健康、资源与环境、新材料三大领域，重点突出健康和生命、环境和生态系统、资源利用与开发、新材料、能源开发应用和国家安全等领域中相关的基本有机化学课题等六大研究方向，带动化学生物学、金属有机化学、有机合成化学、元素有机化学、物理有机化学、化学信息学、有机材料化学和有机分析化学等八大学科发展。

建所以来，共获各种科研成果奖348项，包括国家三大奖72项，其中国家自然科学一等奖3项（其中2项为合作）、二等奖18项（其中1项为合作）；国家创造发明奖3项和国家发明二等奖4项（其中3项为合作）；国家科技进步奖特等奖3项（合作），一等奖1项（合作），二等奖11项（其中5项为合作）；获得包括中国科学院自然科学一等奖28项在内的中国科学院各类奖145项。

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